12.3. Parciális szavak

Az eddigiekben feltettük, hogy a DNS nagyon pontosan csak a bázispároknak megfelelően kapcsolódik. A természetben éppen ez jelenti a DNS molekula megbízhatóságát, elég stabil, és képes arra, hogy hibátlanul másolódjon (pl. osztódáskor). A DNS a gyakorlatban általában megfelelő bázissorrend esetén kapcsolódik össze. Viszont már a törlő-beszúró rendszereknél láttuk, hogy két egyszálú molekula akkor is összekapcsolódhat ha csak részben egymás komplementerei, és ezt ki is használtuk abban a modellben.

Ha elképzelünk pl. két 1000 hosszúságú molekulát amikben közepén csak egy bázis nem stimmel, akkor érezzük, hogy ez nem biztos, hogy megakadályozza a két molekula összetapadását... A gyakorlatban két DNS lánc összetapadhat akkor is, ha benne néhány (nagyon kevés) nukleotid nem bázispárt alkot, a többi nukleotid hidrogénkötése összetarthatja a molekulát. Ezen molekulák ihlették a parciális szavak elméletét. Az előforduló DNS hibákkal rendelkező molekulákat modellezhetjük így. Ahol nem bázispár van, oda egy luk kerül jelezve, hogy nem ismert az adott betű teljes biztonsággal, a luk mintegy dzsóker karakter szerepel. Kombinatorikai szempontból sok érdekes eredmény van ezekre a „lukas szavakra".