A rendszerkatalógus fizikai helye és beállítása a rendszer teljesítményére hatással lesz. Az adatbázis-adminisztrátornak kell eldöntenie, hogy hová telepítse, milyen típusú lemezre, és mennyi helyet foglaljon le neki. Ezt a döntést általában telepítési időben kell meghozni.

A rendszerkatalógust egy szeparált lemezterületen helyezzük el, így más alkalmazás adatoktól függetlenül lehet kezelni és hangolni. Ha lehet egy vagy két lemezkötetet dedikáljunk a rendszerkatalógusnak. Az indexeket és a táblákat külön lemezköteten helyezzük el. Ha az adatbázis-kezelő rendszer még nem rendelkezik adatgyorsítóval a rendszerkatalógushoz, akkor különítsünk el neki egyet. Ez megkönnyíti a rendszer input/output műveletei hatékonyságának a nyomkövetését.

Ha a rendszerkatalógusban változtatást kell végezni, akkor segédprogramokat, mint REORG, COPY vagy RECOVER vagy állományrendszer parancsokat kell használni. A változások lehet, hogy növelik a rendszerkatalógust: pl. új index hozzáadásával vagy az adatbázis-kezelő rendszer új verzióra migrálásával.